De tre mest almindelige typer overførselsmembraner, der anvendes til protein- og nukleinsyreoverførselsdetektion, er nitrocellulosemembraner, polyvinylidenfluorid (PVDF)-membraner og nylonmembraner. Nitrocellulosemembraner er en almindeligt anvendt matrix i proteinblotting på grund af deres høje proteinbindingsaffinitet og kompatibilitet med forskellige detektionsmetoder. Proteinbindingskapaciteten af nitrocellulosemembraner er 80-100 µg/cm², og proteinimmobilisering sker hovedsageligt gennem hydrofobe interaktioner. Nitrocellulosemembraner er skøre og skrøbelige, hvilket begrænser deres anvendelse til mærkning og ommærkning.
Polyvinylidenfluorid (PVDF) membraner har en høj bindingsaffinitet for både proteiner og nukleinsyrer. PVDF-membraner er meget hydrofobe og skal for-befugtes med methanol eller ethanol før nedsænkning i transferbuffer. Proteinbindingskapaciteten af PVDF-membraner er 170-200 µg/cm². Sammenlignet med nitrocellulose er PVDF-membraner mindre skøre og skrøbelige, har bedre mekanisk styrke og kemisk stabilitet og er velegnede til Western blotting-eksperimenter, der kræver mærknings- og ommærkningstrin. På grund af deres hydrofobicitet er PVDF-membraner et foretrukket valg til hydrofobe proteiner.
Nylonmembraner binder proteiner og nukleinsyrer gennem ioniske, elektrostatiske og hydrofobe interaktioner. Proteinbindingskapaciteten af nylonmembraner kan nå op på 480 µg/cm². Nylonmembraner udviser høj holdbarhed, hvilket giver fordele i Western blotting-eksperimenter, der kræver mærknings- og ommærkningsprocedurer. En væsentlig ulempe ved at bruge nylonmembraner til blotting-applikationer er potentialet for ikke-specifik binding med anioner.